甬臺溫高速公路大溪嶺—湖霧嶺隧道管理所，于1998年12月成立，由臺州市、溫州市兩地高速公路業主單位聯合設立。隧道管理所統一管理全隧道洞內外的設施，負責對隧道各種設備設施的定期檢查和維護，保障隧道內行車的安全暢通舒適，并負責做好監控工作，及時發現、報告并快速恰當地處理所轄范圍內各類事故和隱患，并協助相關部門做好各類事件的處理。根據高速公路特長隧道技術密集和連續運轉的特點，同時設立大溪嶺隧道營運領導小組，由兩地市高速公路主管單位同交警、路政負責人及管理所負責人共同參與，對于營運管理中出現涉及不同部門工作領域的事件，由隧道所協調解決，以形成集中統一的營運管理。

隧道管理所現有員工36人，管理人員采用矩陣制組織機構，三班兩運轉管理模式。其特點是：在隧道所縱向職能系統基礎上，增加了一種橫向職能系統的聯系和管理，即把按日常行政職能劃分的三個執勤隊和按專業范圍劃分的專業班（中控班、機電班、安保班）結合起來， 每個隊員同時受執勤隊和專業班兩方面的管理，容易溝通信息、強化協調、提高效率。